Une méthode de vraisemblance rapide pour reconstruire et visualiser des scénarios ancestraux

L’Institut Pasteur est à la pointe de la biologie computationnelle. Des chercheurs de l’unité de Bioinformatique évolutive viennent de mettre au point le programme PastML. Cet outil, développé à partir de concepts de la théorie de la décision, reconstruit des « scénarios ancestraux » qui décrivent l’évolution de traits ou caractères le long d’arbres phylogénétiques. Ces caractères peuvent être très variés et représenter la morphologie des espèces étudiées, des propriétés biochimiques de protéines issues d’une même protéine ancestrale, l’origine géographique d’une épidémie et sa diffusion à travers le monde, ou encore l’apparition et la diffusion de résistances aux traitements. En quelques minutes, PastML analyse d’immenses quantités de données et met en avant les hypothèses les plus probables, de façon précise et robuste. PastML est à la disposition de la communauté scientifique internationale, comme le sont Phylogeny.fr depuis 2008 et maintenant NGPhylogeny.fr, sa nouvelle version entièrement rebâtie en 2019 par les mêmes équipes.

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