CoronaFISH : une nouvelle méthode pour étudier le SARS-CoV-2 et détecter sa présence dans l’organisme

La pandémie de Covid-19, qui touche le monde depuis plus de deux ans, est causée par le SARS-CoV-2. Le génome de ce virus respiratoire est constitué d’un unique brin d’ARN, une molécule proche de l’ADN qui permet au virus de se répliquer dans l’organisme. Des chercheurs de l’Institut Pasteur, de l’Inserm et de l’Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) ont mis au point une nouvelle méthode, CoronaFISH, pour observer le virus et détecter sa présence.

Depuis le début de la pandémie, un enjeu majeur est d’étudier la biologie du virus dans les cellules et détecter sa présence dans des organes ou patients infectés. Pour cela, il faut des outils permettant de le visualiser par microscopie. « Plusieurs techniques existent actuellement, mais la plupart ont des limitations, soit parce qu’elles sont indirectes, chères ou peu robustes. Par exemple, on peut utiliser des anticorps pour révéler des protéines du virus, mais l’obtention de ces anticorps est longue et coûteuse, leur sensibilité est compromise par les variants et la présence de protéines virales dans une cellule n’implique pas forcément que le virus s’y réplique activement » explique Christophe Zimmer, responsable du laboratoire Imagerie et modélisation à l’Institut Pasteur.

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