Des génomes entiers assemblés sur de simples ordinateurs portables

Des chercheurs de l'Institut Pasteur et du Massachusetts Institute of Technology (MIT) ont mis au point une technique de reconstruction rapide de génomes entiers, tel le génome humain. S’inspirant du traitement automatique des langues, qui permet d’agencer des mots plutôt que des lettres, les chercheurs ont entrepris de représenter les données génomiques par des blocs de lettres. Cette méthode leur a permis de reconstruire un génome humain en un temps record, et avec une économie de moyens informatiques considérable : la reconstruction est cent fois plus rapide et ne nécessite qu’un cinquième des ressources génomiques actuelles, comparée aux approches d’assemblage existantes, pourtant de pointe.

En savoir plus