Mieux classer les souches bactériennes pour mieux les surveiller

La plupart des espèces de bactéries présentent une immense variété de souches, dont la résistance aux antibiotiques, la virulence ou le potentiel de transmissibilité varient de l’une à l’autre. L’identification précise de ces différentes souches est donc un enjeu de santé publique majeur pour permettre une surveillance efficace des agents infectieux. Cependant, la taxonomie des souches bactériennes émergentes fait largement défaut à l’heure actuelle, ce qui complique la communication des scientifiques et la surveillance épidémiologique. Dans une publication parue dans Molecular Biology and Evolution, des chercheurs de l’Institut Pasteur proposent de nouveaux outils de classification génomique applicable aux souches bactériennes.

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