enseignement
Les formations du bureau de la vie étudiante pour accompagner les doctorant(e)s de l’Institut Pasteur
Le pôle des doctorantes et doctorants (pôle Doctoral), placé sous l’égide de la direction de l’enseignement, accompagne les doctorant(e)s des campus de l’Institut Pasteur tout au long de leur thèse. Il constitue un point de référence pour les questions professionnelles, administratives et d’intégration, tout en contribuant à optimiser les formations spécifiquement destinées aux jeunes scientifiques.
Le pôle s’organise autour de quatre composantes complémentaires :
le bureau de soutien académique aux doctorantes et doctorants, en charge des aspects administratifs ;
le bureau des programmes doctoraux internationaux, dédié notamment au programme Pasteur-Paris University (PPU) ;
le bureau du tutorat des doctorantes et des doctorants, qui accompagne les doctorant(e)s dans leur parcours ;
le bureau de la vie étudiante, soutient les doctorant(e)s dans leur intégration et leur quotidien. Il pilote, en plus de l’hébergement et des programmes de Master et de mobilité étudiante, l’offre de formations doctorales, en lien avec plusieurs entités du campus.
Le bureau de la vie étudiante, au cœur de la formations des jeunes scientifiques de l’Institut Pasteur Parmi ces composantes, le bureau de la vie étudiante joue un rôle central. Coordonné par Stefaniia Ivashchenko. Son action en lien avec les formations, repose sur trois axes : centraliser les cours et ateliers obligatoires et optionnels, orienter les doctorant(e)s vers les bons interlocuteurs et contribuer à la délivrance de certificats de présence valorisables auprès des écoles doctorales. Ces formations couvrent des thématiques devenues incontournables dans les sciences du vivant, comme l’intelligence artificielle, la bioinformatique, et la science ouverte. Elles permettent aux doctorant(e)s de consolider leurs acquis, de gagner en autonomie et de s’approprier des pratiques de recherche essentielles dès le début de leur thèse. Le bureau de la vie étudiante communique et co-organise les formations pour les doctorant(e)s en collaboration avec le pôle Compétences et formation de la direction des ressources humaines (éthique et intégrité, formations linguistiques, le pôle StartUp (DARRI), etc. | ||
Intelligence artificielle appliquée aux sciences de la vie
Le parcours ”Intelligence artificielle appliquée aux sciences de la vie” s’inscrit dans le plan stratégique Pasteur 2030 et permet d’aborder les bases théoriques de l’IA ainsi que ses usages en biologie, de la génomique à l’analyse d’images, en passant par les neurosciences et la biologie structurale.
Ernest Mordret, chercheur dans le groupe à 5 ans (G5) Diversité moléculaire des microbes, qui étudie l’évolution des génomes bactériens à l’aide de l’IA ; Massimiliano Bonomi, responsable de l’unité à 5 ans (U5) Biologie structurale computationnelle ; et Laura Cantini, responsable du groupe à 5 ans (G5) Apprentissage automatique pour la génomique intégrative. Ensemble, ils présentent le cours et rappellent que l’IA constitue aujourd’hui un outil majeur pour la biologie et que les doctorant(e)s doivent apprendre à l’intégrer avec discernement dans leurs travaux.
Découvrir la courte vidéo donnant la parole à ces trois ses directeurs du programme
Maria Colonna, doctorante en première année à l’Institut Pasteur, souligne l’intérêt de cette formation pour mieux comprendre les modèles qu’elle utilise déjà dans sa thèse : « Il est utile de comprendre les mathématiques derrière les modèles et ce qu’il se passe lorsque nous utilisons des outils comme ChatGPT. Cela permet aussi de voir comment cette même structure peut s’appliquer à des séquences biologiques, comme les protéines ou l’ADN, ainsi qu’aux structures protéiques. Dans mon cas, la formation a été très constructive, car je travaille avec des grands modèles de langage. Il a donc été précieux d’en apprendre davantage sur leur fonctionnement, sur ce qu’il est possible d’en faire, et sur la manière de protéger notre propriété intellectuelle. C’est une bonne chose d’avoir cela dès la première année de doctorat, pour connaître les possibilités qui s’offrent à nous et comprendre ce qui se passe à l’intérieur de la boîte noire. »
Éveil à la science ouverte
La formation ”Éveil à la science ouverte” invite, quant à elle, à mieux comprendre un mouvement scientifique en pleine évolution. Elle sensibilise aux principes, valeurs et outils de la science ouverte, dans une logique de partage et d’ouverture des connaissances.
Rania Sabo, spécialiste de programme adjointe au sein de l’UNESCO, et intervenante dans cette formation, rappelle que la science ouverte est « un ensemble inclusif de multiples processus et mouvements qui convergent pour démocratiser l’ensemble du processus de recherche scientifique ». Elle invite aussi les tous les jeunes scientifiques à commencer par consulter la recommandation de l'UNESCO sur la science ouverte afin d'en saisir les fondements et la portée, afin de l'intégrer dès le début de leurs carrières.
Cette formation comprend un tronc commun obligatoire, avec deux sessions par an et une inscription automatique des doctorant(e)s en première année, ainsi qu’un atelier pratique « Open Science - qu’est-ce que j’y gagne ? » et une mise en perspective des ressources disponibles sur le campus par l’équipe du CeRIS. Il est complété par des formations du CeRIS, des ressources du pôle Compétences et formations RH et plusieurs outils externes comme OpenPlato la plateforme de formation en ligne dédiée à la science ouverte ou le MOOC « Science ouverte ».
Bioinformatique et Data Science
Le programme Bioinformatique et Data Science complète cet ensemble avec un socle en bioinformatique, biostatistique, gestion des données et analyse d’images. Pensé pour les doctorant(e)s de l’Institut Pasteur, il leur permet d’acquérir ou de revoir les notions fondamentales de ces domaines grâce à une approche théorique et pratique.
La formation se décline en plusieurs modules, avec un tronc commun, un volet biostatistique, un volet bioinformatique et un volet analyse d’images. Selon leur parcours, les doctorant(e)s sont encouragé(e)s à suivre les modules de gestion des données, de biostatistique et de bioinformatique de base, puis à compléter leur parcours avec des modules plus spécialisés.
Contacts :
PhD Training Hub : phdtraining@pasteur.fr