Informations et organisation relatives aux services de NGS à l’Institut Pasteur

L’Institut Pasteur fournit aux chercheurs et aux entités de santé les tout derniers outils d’analyse et de séquençage dédiés aux recherches d’envergure internationale et aux enjeux mondiaux de santé publique. Cette initiative est encadrée par le Biomics UTechS en collaboration avec la plateforme de microbiologie mutualisée (P2M) et la cellule d’intervention biologique d’urgence (CIBU). Les échantillons et projets de l’Institut Pasteur étant divers et variés, les laboratoires représentés ont coordonné un point d’entrée réservé aux services et à l’expertise, organisé comme suit :

• Les projets de microbiologie sont classés par catégorie d’échantillon.

1- Les échantillons relevant des CNR, urgences épidémiques et autres questions de santé publique doivent être directement dirigés vers les plateformes du PIBnet (P2M/CIBU) : pibnet@pasteur.fr.

2- Tous les autres échantillons orientés recherche, y compris les études sur le RNA-Seq, peuvent être adressés au Biomics : biomics@pasteur.fr.

• Les projets de séquençage du génome (WGS) et de l’exome (WES) complets des eucaryotes ne sont actuellement pas menés sur le campus en raison des équipements imposants qu’exige ce type d’étude. Les demandes d’informations portant sur les services de séquençage peuvent être adressées au comité sur les eucaryotes et la génomique humaine (biomicsHWGS@pasteur.fr). Les personnes intéressées peuvent bénéficier de conseils sur la préparation des échantillons, la collaboration analytique/l’orientation des services ainsi que de tarifs spécialement négociés pour l’Institut Pasteur. Les demandes de RNA-Seq et d’analyses par puces (SNP et méthylation) peuvent être envoyées directement au Biomics : biomics@pasteur.fr.

Les comités sur le NGS microbien et sur les eucaryotes et la génomique humaine sont composés d’experts dans leurs domaines. Ces comités traitent chaque semaine les demandes de projets et se réunissent deux fois par an pour coordonner les technologies et services de NGS pour l’Institut Pasteur. Adressez vos questions et commentaires à : sean.kennedy@pasteur.fr.